مخزن مخطوطات و نفايس كتابخانه آستان قدس رضوي گنجينه ميراث مكتوب اين مرز و بوم مي باشد كه با داشتن مجموعه اي غني همواره توجه پژوهشگران و شيفتگان علم و ادب را از سرتاسر گيتي به سوي خود جلب نموده است. در حال حاضر اين گنجينه 33253 نسخه كتاب خطي، 3286 نسخه قرآن خطي، 10513 نسخه جزوات خطي قرآن ها، 2339 نسخه عكسي، 695 نسخه دستنوشته، 2162 فقره اسناد مالكيت، و 930 وقفنامه،‌  5250 ساير مكتوبات خطي، 37816 حلقه ميكروفيلم، 9 عدد مرقعات، 33575 كتاب چاپ سنگي را در خود جاي داده است كه قديميترين نسخه خطي (شرح ديوان تميم ابن مقبل) است كه به سال  380 ه.ق. باز مي گردد. مجموعه نسخه هاي خطي به تفكيك موضوعي تحت مجموعه فهرست الفبايي كتب خطي كتابخانه مركزي آستان قدس رضوي كه 21 جلد آن تاكنون منتشر شده است، معرفي شده اند. براي جستجوي اطلاعات كتابهاي خطي مي توان به فهرستگان پيوسته كتابخانه - پايگاه نسخه هاي خطي رجوع كرد.